MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020568	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020568	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020568	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020568	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020568	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020568	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020568	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020568	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020568	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020568	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020568	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020568	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020568	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020568	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020568	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020568	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_020568	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020568	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020568	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020568	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020568	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020568	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020568	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020568	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020568	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020568	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020568	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020568	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020568	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020568	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020568	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020568	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020568	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020568	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020568	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020568	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020568	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020568	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020568	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020568	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020568	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020568	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020568	A	7	7	9676	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020568	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020568	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020568	ATT	3	9	10673	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020568	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020568	ACA	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020568	ATA	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020568	AAG	2	6	10858	10863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020568	TAA	2	6	12484	12489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020568	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020568	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020568	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020568	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020568	T	7	7	12716	12722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020568	A	6	6	12730	12735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020568	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020568	ATA	2	6	12755	12760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020568	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020568	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020568	ATA	2	6	14149	14154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020568	GTG	2	6	14164	14169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020568	T	7	7	14186	14192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020568	AAC	2	6	14228	14233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020568	CAA	2	6	14281	14286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020568	ATG	2	6	14299	14304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020568	TAT	2	6	14344	14349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020568	A	6	6	14365	14370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020568	GTA	2	6	14385	14390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020568	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020568	GAT	3	9	14425	14433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020568	TCA	2	6	14469	14474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020568	A	6	6	14483	14488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020568	AAC	2	6	14509	14514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020568	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020568	GAT	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020568	TAT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020568	T	6	6	14683	14688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020568	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020568	AGG	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020568	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020568	TGT	2	6	15529	15534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020568	ATT	2	6	15593	15598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020568	ATT	2	6	15704	15709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020568	TCA	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020568	CTT	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020568	T	7	7	16088	16094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020568	AGG	2	6	16100	16105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020568	TA	3	6	17088	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020568	CTA	2	6	17110	17115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020568	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020568	AAT	2	6	17211	17216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020568	CA	3	6	17234	17239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020568	TTA	2	6	17285	17290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020568	ATA	2	6	17354	17359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020568	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020568	A	6	6	20331	20336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020568	AAG	2	6	20347	20352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020568	CTT	2	6	20375	20380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020568	A	6	6	20442	20447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020568	CAA	2	6	20466	20471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020568	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020568	GGT	2	6	20547	20552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020568	AGTA	2	8	20567	20574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020568	ATTC	2	8	20652	20659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020568	AAG	2	6	20695	20700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020568	AC	3	6	20720	20725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020568	AAT	2	6	22187	22192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020568	GAT	2	6	22199	22204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020568	AT	3	6	22242	22247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020568	TA	3	6	23737	23742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020568	AGG	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020568	TTTG	2	8	23804	23811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020568	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020568	GAT	2	6	23890	23895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020568	AAG	2	6	23909	23914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020568	TAA	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020568	ATT	2	6	24021	24026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020568	ATA	2	6	24027	24032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020568	TTC	2	6	24072	24077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020568	A	6	6	24078	24083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020568	A	6	6	24101	24106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020568	ATCT	2	8	24139	24146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020568	CGG	2	6	24197	24202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020568	T	6	6	24235	24240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020568	GCCT	2	8	24267	24274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020568	T	7	7	24343	24349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020568	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020568	AT	3	6	24375	24380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020568	TTA	2	6	24492	24497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020568	TTC	2	6	24529	24534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020568	CCA	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_020568	TCC	2	6	24553	24558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_020568	AAT	2	6	24590	24595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020568	ATTT	2	8	24599	24606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020568	TAT	2	6	24651	24656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020568	TCA	2	6	24670	24675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020568	CCG	2	6	24701	24706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_020568	TAA	2	6	24715	24720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020568	A	6	6	24719	24724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020568	AT	3	6	24730	24735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020568	TA	3	6	24781	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020568	T	6	6	24855	24860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020568	A	6	6	24885	24890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020568	ATA	2	6	24898	24903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020568	TAA	2	6	29600	29605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020568	TCA	2	6	29621	29626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020568	TAA	2	6	29787	29792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020568	ATA	2	6	29861	29866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020568	AG	3	6	29951	29956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020568	CTG	2	6	30807	30812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_020568	GAC	2	6	30816	30821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020568	T	6	6	30834	30839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020568	TGG	2	6	30847	30852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020568	TGT	2	6	30861	30866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020568	A	6	6	30893	30898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020568	AAT	2	6	30925	30930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020568	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_020568	AT	3	6	33326	33331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020568	TAC	2	6	33341	33346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_020568	T	7	7	33377	33383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020568	A	6	6	33388	33393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020568	TAA	2	6	33437	33442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020568	T	6	6	34177	34182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020568	AAG	2	6	34254	34259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_020568	ATA	2	6	34328	34333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020568	TTCT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_020568	ATAA	2	8	34430	34437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020568	GAA	2	6	34447	34452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020568	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020568	TAA	2	6	35784	35789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020568	TAAA	2	8	35807	35814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020568	A	6	6	35838	35843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020568	T	6	6	35895	35900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020568	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_020568	TAA	2	6	35939	35944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020568	A	6	6	35949	35954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_020568	ATT	2	6	35979	35984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_020568	TA	4	8	35993	36000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020568	TAA	2	6	36011	36016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_020568	AT	3	6	36025	36030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_020568	AAT	2	6	36035	36040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020568	T	6	6	36059	36064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020568	ATG	2	6	36118	36123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020568	ATT	2	6	36181	36186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_020568	TAT	2	6	36215	36220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_020568	TTA	2	6	36277	36282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_020568	GAA	2	6	36445	36450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_020568	AGA	2	6	36546	36551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_020568	T	6	6	36659	36664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_020568	T	7	7	36687	36693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_020568	TTTTG	2	10	45118	45127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_020568	TAA	2	6	45479	45484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_020568	TTG	3	9	45677	45685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_020568	T	6	6	46351	46356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020568	TTA	2	6	46370	46375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020568	ATA	2	6	46399	46404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020568	TTTC	2	8	46457	46464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
290	NC_020568	A	6	6	46543	46548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_020568	TTC	2	6	46570	46575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_020568	GTAA	2	8	46583	46590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020568	CAT	2	6	46659	46664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_020568	CAA	2	6	46731	46736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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